а как сделать чтобы в эту область грузились ссылки без обновления остальной части страницы?

никак только фрэймами. если я правильно тебя понял.
Только возникает вопрос зачем все так упорствуют на не обновлении остальной части страницы. она и так не изменится, просто перегрузится как шаблон с уже новым содержанием - по-моему преимущества этого варианта очевидны.

наверное, чтобы не иметь гимора с перегрузкой остальных элементов.

Поясните, в чем геморрой? Если элементы графические, то они, как известно, кэшируются браузером - так что с этой стороны геморрой отпадает.
Проблема с перезанрузкой страницы более чем надуманна. Куда лучше сделать явную, визуально понятную структуру, где переходы между страницами очевидны, чем использовать фрэймы. Один геморрой с фрэймов поисковиками чего стоит.
ПРеимущество серверных технологий абсолютно.

если я зделаю include(переменная), а потом чтобы перейти на какую нибуть страницу буду обращаться к одному и тому же файлу только с разными параметрами (этой переменной). ну думаю поняли :p
Уменьшится ли находимость?? и какие недостатки?

А как насчёт флэш меню с продолжительной анимацией, которую не хочется прерывать. Пример:www.razbeg.ru Что делать в этом случае?

Со звуком еще хуже.