[dark256]

Фотошоп.
Открыть оригинал.
Открыть имидж с альфами.
Перетащить альфу в ориг.
Сделать по альфе селекцию. Вырезать из оригинала.
Сохранить оригинал с прозрачностью как PNG

ЕСЛИ таких наборов очень много - у фотошопа есть система пакетной обработки изображений.