[E.Q.]

Код загружаемого клипа должен выполняться.

А что за код внутри него? Если этот код обращается к своему кодовому содержимому через _root, то он будет стучаться к руту клипа его загрузившего. Попробуйте установить свойство _lockroot = false у загружаемого клипа.