Спасибо за ответы. JS никакого добавить не удастся, html-а не будет, будет только вызываться сама главная флешка в новом окне. Получается флеш не может сэмулировать вызовы JS?
Добавлено через 1 час 19 минут
Урра, проблема разрешилась.
С помощью декомпилера удалось выяснить название класса который отвечал за команды проигрывания + названия этих команд (они оказались статическими).
Потом из загруженной флешки удалось получить ссылку на нужный класс
Код AS3:
WavPlayer = loader.content.loaderInfo.applicationDomain.getDefinition("WavPlayer") as Class;
И вызвать нужную функцию
Код AS3:
WavPlayer.play(url);