[fantomasdnb]

и так код теперь выглядит так

 
if (commandBlock.added)
{				
	var numChildren:uint = this.codeCont.codePlateSp.numChildren;
 
	for (var i:uint = 0; i < numChildren; i++)
	{
		var block:commandBlock = this.codeCont.codePlateSp.getChildAt(i) as commandBlock;					
		instruct = block.getCommand;								
 
		commandArray[instruct.charAt(0)]={};
		commandArray[instruct.charAt(0)][instruct.charAt(1)] = instruct.substr(2,3);
 
 
 
	}				
	trace(commandArray["A"]["1"]);
	trace(commandArray["A"]["0"]);
}

но строка commandArray["A"] = {}; на втором шаге цикла, убивает всё что было добавлено на первом, тоесть трейс выводит
undefined
1HO