А я разве не об этом говорю? Вот у Вас три иконки скажем, в контейнере и в массиве. Вы сравниваете их с iconMC (впрочем Вы сравниваете зачем-то id. Зачем, если в массиве такие же ссылки на клипы иконок, как и переменная iconMC?) Ну а сама iconMC это что? Это последняя из добавленных иконок (бонусов). То есть я, например, не могу понять из вашего кода, над какими объектами производятся действия и как по одному конечному таймеру отсчитывается время жизни для нескольких бонусов. Вам бы с этим для начала разобраться, не с красотами всплывания.
И не slice, а splice. Slice не изменяет массив, к которому применяется, а возвращает новый. То есть вот так будет возвращен массив с одним вырезанным элементом. В этом смысл слова slice ("ломтик").
Код AS3:
var newArray:Array = iconsArray.slice(i, 1);
А Вам нужен сплайс.
Код AS3:
iconsArray.splice(i, 1);