Ну у меня похожая ситуация, при подгрузке 2го свф файла делаю addChild(swf2); потом когда надо убрать свфку делаю removeChild(swf2); и создал во 2ой свфке метод, в котором присутствет

Код AS3:
ns.close(); // NetStream
nc.close(); //NetConnection
video.clear();
// video:Video
незнаю насколько это правильно, но вроде по примерам все сделано правильно =)