[F10]

Flash Develop - быстр. Из-за неудобного дебагера, поиска ссылок и рефакторинга большой проект наверно будет тяжко писать. И минус - нет инлайн подсветки, вроде так называется (быстро привыкаешь кликнуть по переменной или методу и сразу увидеть в каких местах класса она используется).

FDT - медленный, грамоздкий. Клевый дебагер, медленный автокомплит (ищет варианты долго). Работа c SVN прямо из редактора (может и у других редакторов это есть, хз).

Flash Builder - тот же FDT, только очень удобно разрабатывать flex проект, и реально ближе флешу, аиру и т.п. Даже просто AIR проект создать на нем легче, все заранее настроено.

p.s. С удовольствием бы сидел только на Flash Develop, если б был больше приспособлен для больших проектов. Хотя разные плагины к нему не ставил, возможно можно что-то улучшить в нем.