Скроллер может быть только один, поэтому конечно писать лучше во вреппере. wvxvw - про было бы идеально не понял немного о какой ситуации идет речь.
У меня приблизительно щас так :

Код AS3:
public class ContentWrapper extends Sprite implements IDestroyable
public function init(sectionData:XMLList)
{
....
}
public function openContent(sectionID:int):void
{
switch(sectionID)
case 0: this._section = new PortfolioSection();
break;
case 1: this._section = new ContactSection();
break; ....
this.addchild(this._section);
this._section.init( sectionData["section_" + sectionID] );
this._section.addEventListener(WrapperEvent.CHECK_SCROLL , onCheck);
}
private function onCheck(e:WrapperEvent):void
{
if(e.param == "scroll.hide") this._scroll.destroy();
else
{
this._scroll.define( e.param[1] , e.param[2] ... )
}
}