Можно сделать штатными средствами, например с помощью класса Color:
Код AS3:
import fl.motion.Color;
var myColor:Color = new Color();
myColor.setTint(0xFF0000);
myObj.transform.colorTransform = newColor;//объекту myObj задаётся красный оттенок
Ещё можно реализовать TweenMax-ом, у него тоже есть метод tint и тогда цвет будем менять плавно!