А ошибку какую-нибудь выдает, или просто молча не работает? Возможно поможет такая замена:
Код AS3:
var link1:String = stage.loaderInfo.parameters.link1;
Предоставьте больше информации и вам помогут быстрей. Покажите также как вы JavaScript'ом передаете flashVars.
А, погодите, у вас, похоже, кавычки лишние:
Код AS3:
navigateToURL(new URLRequest(link1));
Можно вообще так написать функцию
clicked:
Код AS3:
function clicked(e:MouseEvent):void {
var url:String = stage.loaderInfo.parameters.link1;
if (url)
navigateToURL(new URLRequest(url));
else
trace("No url.");
}