Тут надо сделать следующее:
1. Для вывода времени сервера в нужном формате в параметре публикации flashvars нужно разобраться, как выводится время посредством PHP.
Смотрим тут.
2. Правильно опубликовать флешку на странице (с применением вышеупомянутого параметра flashvars). Использовать надо
SWFObject (рекомендую динмич. способ).
Видимо, рациональнее всего выводить во flashvars несколькими переменными год, дату, час, минуты и секунды.
3. После этого использовать
конструктор Date с применением данных из flashvars наподобие:

Код AS1/AS2:
// Старт:
startTime = new Date(parseInt(currentYear), parseInt(currentMonth), parseInt(currentDay), parseInt(currentHour), parseInt(currentMinute), parseInt(currentSec)).getTime();
где все эти currentXxx - переменные, переданные через flashvars.
И далее по коду от
expl или моему выше.
Как-то так.
PS. К сожалению, лично написать все это за вас не могу.