[wvxvw]

Из всего, что можно сделать для Линукса на флеше - Вайн самое работоспособное решение. Но есть другой момент... нормальный пользователь Линукса вряд ли будет устанавливать программы не из известных ему репозиториев. Как правило это только репозиторий системы + один-два общеизвестных, вроде Launchpad / Rpmfusion. Проприетарный софт ставят только те, кого заставляют это делать / нет другого решения. Например, в лаборатории могут установить всем сотрудникам какую-нибудь специальную программу, или, драйвера для какого-нибудь куска железа, ну, или игрушки.
Если это программа не на столько полезна / незаменима для линуксовой аудитории, я думаю, про этот сегмент рынка можно не вспоминать.

Хотя, конечно, люди разные бывают...