Там есть файл правил, который можно править под свои нужды.
Вот этим правило можно настроить подправить сохранить:
flex-pmd-ruleset-creator
А вот этим можно просмотреть отчет (тулза генерит хмл с отчетом. Но фд и сам всё красиво показывает так что для ФД не оч надо. Но сам инструмент самодостаточный, можно хоть из командно\й строки запускать)
flex-pmd-violations-viewer
Добавлено через 30 секунд
Но вопрос открыт.
Что не так с пмд ф фд?