Через кадр уже поздно будет, нужно сразу, объект добавляется в самописный контейнер Box, наподобие флексовского с автопозиционированием и из-за некорректных размеров все катится к черту.
В общем придется изменять алгоритм отрисовки узора, чтобы он был в рамках координат маски
Я предполагал, что маскированный объект изменяется по размеру маски, а это не так, что в принципе тоже логично, т.к. маска влияет только на визуализацию.
Если кому интересно, нашел фантастическое решение проблемы:

Код AS3:
new BitmapData(1,1).draw(displayObject);
FP будет вынужден обновить для этого объекта реальный размер прямо в текущем кадре. Я поместил это в глобальную функцию, которую можно дергать сразу после изменения scrollRect

Код AS3:
package
{
import flash.display.BitmapData;
import flash.display.IBitmapDrawable;
public function updateRealSize(displayObject:IBitmapDrawable):void
{
new BitmapData(1,1).draw(displayObject);
}
}

Код AS3:
...
_fill.scrollRect = new Rectangle(0, 0, _width, _height);
updateRealSize(_fill);
...