Скорей всего автор имеет в виду - внутри fla.
А так ответ уже дали - используйте [Embed]
Тогда на этапе разработки всё папочки и картинки будут лежать рядом.
Другое дело, что описания картинок могут храниться в xml, тогда нужно придумать как получать к ним доступ и как прописать компилятору, какие картинки нужно включать в итоговый swf/exe
Для этой задачи может подойти плагин для FlashDevelop -
AssetPackager.
Генерим swc c картинками и xml - включаем этот swc полностью в итоговый проект + прописываем в основном коде новое правило для парсинга xml, я подозреваю, что там сейчас только пути для загрузки, нужно распарсить эти пути и не загружать, а создавать эти картинки через

Код AS3:
new images.somePicture()
(пример для картинки images/somePicture.jpg)