можно. Вот скрин из настроек приложения:
http://take.ms/othFe
У них в хелпе даже есть готовые AS классы для работы с их API именно для приложений которые не используют iframe и следовательно не используют JS для связи контакта с флешкой.
Добавлено через 1 час 0 минут
Вы мне главное скажите, есть ли что-то кроме allowFullScreen, что может запретить переход в полноэкранный режим? Если больше ничего нет, то я буду писать в техподдержку.