Та же проблема с моим FlashDevelop
Система Win10 64bit
Flex 4.6.0, AIR 15,0
FlashDevelop 4.6.4.1 for .NET 2.0
Я пробовал разные Flex версии
и даже пытался использовать flashplayer16_debugsa_win_32.exe
новая установка FlashDevelop тоже не помогало
Я использую
Release большую часть времени
Но результат тот же с
Debug

Код:
Building Prototype 4
mxmlc -load-config+=obj\Prototype4Config.xml -debug=true -incremental=true -swf-version=20 -o obj\Prototype4635569482091080022
Starting java as: C:\Progra~2\Java\jre6\bin\java.exe -Xmx384m -Dsun.io.useCanonCaches=false -Duser.language=en -Duser.region=US -Dapplication.home="C:\Users\Anon\AppData\Local\FlashDevelop\Apps\flexairsdk\4.6.0+15.0.0" -Dflexlib="C:\Users\Anon\AppData\Local\FlashDevelop\Apps\flexairsdk\4.6.0+15.0.0\frameworks" -jar "C:\Users\Anon\AppData\Local\FlashDevelop\Apps\flexairsdk\4.6.0+15.0.0\lib\fcsh.jar"
INITIALIZING: Adobe Flex Compiler SHell

Код:
[Fault] exception, information=ReferenceError: Error #1065: Variable FlexVersion is not defined.
at flash.system::ApplicationDomain/hasDefinition()
at mx.core::BitmapAsset()[E:\dev\4.y\frameworks\projects\framework\src\mx\core\BitmapAsset.as:136]