[mikhailk]

Я остановился на Native Client.
Внешне выглядит именно так, как я и хотел - сишная программа упаковывается внутрь плагина как в контейнер, при этом есть возможность передавать в него вызовы со стороны js и по листенеру получать результаты работы кода внутри плагина.

Для простых примеров работает отлично, осталось понять, как собирать на питоне проекты, в которых сишный код распределен по различным каталогам. По умолчанию, понятное дело, сборка идет с файлами в корневом каталоге.

Работает только в хроме, но этого достаточно.