Попробую догодаться
Ты написал алгоритм в котором у тебя на событие от кнопки должно открытся новое окошко да и все...
Хм...
Скажи ты случаем из флеша его не Ctrl+Enter запускаеш ???
а потом кнопочку свою тулиш а ???
Если так то я знаю ответ на твой проблем это потому что скрипт считает что он в окне а так как окно с броузером не открыто то он открывает одно окно для себя а второе как результат функции ...
Кароче это не проблем запусти свой SWF в броузере и всего делов будет отрабатывать только скрипт без всяких побочных ЭФФЕКТОВ
