потому как код скрипта интерпретируется до того как будет обьявлен айди слоя (при загрузке). то бишь когда ты обращаешься к обьекту его еще не существует вот и ошибка
исправляется так:
<html>
<head>
<title>Title here</title>
<script language="javascript1.2">
<!--
function func() {
alert(window.document.all["layer1"].style.visibility);
}
//-->
</script>
</head>
<body onload="func()" leftmargin="0" topmargin="0" marginheight="0" marginwidth="0">
<div id="layer1" style="position:absolute; overflow: visible; left:0 px; top:100 px;
width: 300px; height:300px; visibility:vsible; z-index=1">!!!!!!!
</div>
</body>
</html>