На первом кадре flash-презентации прописываешь следующую команду:
fscommand ("fullscreen", "true");
А дальше заходишь в File > Publish Settings и ставишь галочку напротив Windows Projector (.exe).
Нажимаешь на кновку Publish, и в той папке, где у тебя сохранён твой файл с презентацией появится exe файл.
