ShareObjects.... не предусматривает сохронение XML дерева но веть эту проблему можно решить (Если дерево не очень сложное и тип данных повторяется ) сохроннием переменых например

Код:
var1
var1_2
var1_2
var1_2
var1_2_3
var2
var2_2
я так понял тебе надо хронить координаты обектов твоё дерево может ввыглядеть вот так
ObjectNum1_x
ObjectNum1_y
ObjectNum2_x
ObjectNum2_y
.........
ObjectNumn_x
ObjectNumn_y
не чего другого посоветовать не могу ну кроме того что можно использовать PHP
да если тебе это поможет то обект CustomActions предусматривает сохронение в XML (правдо в момент разроботки клипа

)