Краткие ответы:
1) Можно с помощью Javascript
2) Покрайней мере в 5-ке можно подгружать маленькие видео с помощью load movie, упралять можно, а насчёт программ не знаю! Наверно есть, можно воспользоваться
Яndex , но флэш от большого кол-ва видео тормозит и зачастую аудио звук уходит дальше видео.
3) Спец проги (если у тебя публикация в exe)