В баннере ссылка выглядит так:
on (release) {
getURL(link, "_blank");
}
А на сайте так просто прописываешь этот параметр:
<PARAM NAME=movie VALUE="banner.swf?link1=http://ad2.rambler.ru/ban.clk?pg=4589%26bn=107068"> например через рамблеровский счетчик