Выровнить по центру можно используя javascript, например

Код:
function move2center()
{
var menuWidth = 100; //Ширина твоего Flash
var el = document.getElementById("menu");
el.style.left = (screen.availWidth - menuWidth) / 2 + "px";
}
Убить можно очистив узел баннера, например так (баннер находится внутри div с id="bannerContainer")

Код:
document.getElementById("bannerContainer").innerHTML = "";