jpg вообще не поддерживает прозрачность. В Фотошопе создай изображение на отдельном слое, бэкграунд отключи. При сохранении в gif установи флажок "Transporency", png и так с прозрачностью сохранится. Учти, что gif и png-8 поддерживают только 2х битную прозрачность (либо прозрачный, либо нет), градиентную поддерживает png-24, но его не понимает Internet Explorer

, но для импорта во flash пойдёт.