Такое впечатление, что XML declaration есть только в классе XMLDocument. В документации по XML ничего такого не нашел. Даже если преобразовывать XMLDocument к XML, то оно пропадает.
Код:
var myXML:XMLDocument = new XMLDocument("<?xml version='1.0' encoding='UTF-8' ?><request id=\"ersrqwewr3234qwr32q45rwer\" sid=\""+this.SessionID+"\"></request>");
trace(myXML.toString());
var myXML2:XML = new XML(myXML);
trace(myXML2.toXMLString());