[wvxvw]

если первый файл пришел с одного домейна, а загружаемый со второго, и при этом на втором домейне нет ХМЛя описывающего кому можно, а кому нельзя загружать и выполнять скрипты, то ничего выполнятся и так не будет.
Случай загрузки в другой клип легко проверить, достаточно где-нибудь в руте проверить наличие какой-нибудь переменной, в существовании которой вы уверены (после загрузки рутом станет рут клипа-загрузчика, где этой переменной наверняка не будет). Если переменной нету - просто выгружаем\удаляем загруженный мувик, ну или в фор-ине удаляем все объекты из рута.