Не использовать сцены.
Прочитать этот материал:
http://vmstudio.com/materials.php?noscenes
Он старый, но актуален до сих пор.
Твой код gotoAndStop("имя_сцены", <номер_кадра>); преобразуется в gotoAndStop(<номер_другого_кадра>); на стадии
компиляции, т.е. на выходе нет никаких сцен.