нельзя. сначала енкодим, потом смотрим
я видел, кто-то решал вопрос с переконвертацией потока на лету, но это уже проблемка другого масштаба. Надо брать либы ffmpeg'a и писать свой могучий сервер. Ну или без ffmpeg'a, если хочется самому с конвертацией в flv покопаться.
UPD: да вот жеж:
http://www.flasher.ru/forum/showthread.php?t=95350