нужно использовать т.н. STREAMING звук, во флеш существуют 2 типа звуков "событийные" и "потоковые". Событийные звуки не зависят от временно шкалы но проигрываются в строго определенный момент, а вот потоковые звуки, четко синхронизируются с временной шкалой (то что вам и надо)
подробнее можно почитать например здесь:
http://www.utexas.edu/learn/flash/sound.html
или здесь:
http://www.rastyle.com/articles/index.php?id=20
думаю для профессионала там много интересного...