Ну я нашёл решение, так как mxml тот же по сути xml со своими открывающимися и закрывающимися тэгами то устнавливаем плагин для форматирования xml, лично я установил
XMLBuddy, он бесплатен и в плане функционала тоже вроде нормальный (поюзать пока ещё особо не успел). Устанавливаем, переключаем перпективу на хмл переносим наш уродливый кодик в хмл и нажимаем CTRL + Shift + F (hotkey auto format) в итоге получаем нормально сформатированный код. Единственный минус который я пока успел найти это отсутствие форматирования в блоке CDATA, т.е. если у вас там функции, пееменные и прочее...придёться всёже ручками. Но если вы не пишете код в мхмл то это вас затронуть особо не должно.
Конечно переключать виды не радось большая но во всяком случае лучше чем ручками форматировать десятки а то и сотни строк.