Спешу ответить на свой же вопрос. Пошуршал в интернете, оказалось, что эта тема уже изрядно избита.
Для тех кому интересно решение:
1. во первых помещаем баннер в DIV
<div style="z-index:1">
....баннер...
</div>
2. во вторых в объекте добвляем свойство
<param name="wmode" value="opaque">
и еще не забываем про embed там пишем
wmode="opaque"