[__ant]

Примерно так:

<script type="text/javascript">
  var so = new SWFObject("main.swf","mymovie","100%","100%","8","#FFFFFF")
  so.addParam("allowScriptAccess", "always")
  so.write("flashcontent")
</script>

<script type="text/javascript">
	function changeHeight(height)
	{
		var obj = document.getElementById('mymovie');
		obj.height = height;
	}
</script>

Вызывать java script можно с помощью ExternalInterface.
О поддержки браузерами надо смотреть в хелпе.