добавте к вашему коду проверку на \r и, в принципе будет работать.

Код:
primer.text = "\n\tone\n\ttwo";
perem2 = "\n\tone\n\ttwo";
perem1 = primer.text;
function strsplit(str){
var result:Array = [];
for (var i=0; i<str.length; i++) {
if (str.charAt(i) != "\n" && str.charAt(i) != "\t" && str.charAt(i) != "\r") {
result.push(str.charAt(i));
}
}
return result;
}
trace(strsplit(perem2))
trace(strsplit(perem1))