[_ViPeR_]

Вообще stop(); действует на на слой а на timeline. Я так понял что автору нужно стормозить к.л. клип, при этом остальные должны находиться в режиме play? Если так, то анимируем сам клип, не в _root'е а в самом клипе анимацию делаем и там тормозим