В АС2 без них обойтись невозможно. Можно обойтись без обращений к ним - это да.
prototype.__proto__ - ссылка на родительский класс.
prototype - ссылка на данный класс.
Т.е. у любого созданного вами класса обязательно будут эти свойства.
Код:
class MyClass extends MovieClip {
function MyClass(){}
}
Код:
var myClassInstance = new MyClass();
trace(MyClass.prototype instanceof MovieClip);
trace(MyClass.prototype.__proto__ instanceof Object);