kolin , прочувствуйте разницу:
Ваш код

Код:
//в родительском клипе
clon.onRelease=function(){
_root.frameToJump = this._currentframe;
_root.loadMovie("empty.swf");
}
Мой код

Код:
var mc = _root.createEmptyMovieClip('externalMC', _root.getNextHighestDepth());
clon.onRelease=function(){
_root.frameToJump = this._currentframe;
loadMovie("empty.swf", mc);
}
В этом случае я воспользовался глобальной функцией (Global function) loadMovie вместо метода MovieClip'a mc.loadMovie.
Её синтаксис:
loadMovie(url:String, target:Object, [method:String]) : Void
target - куда грузим внешний клип.
Т.е. я создал пустой мувик mc и в него загрузил внешний клип. В Вашем случае вы перегружаете (замещаете) _root и там просто трется значение переменой frameToJump. Как-то так я думаю.