[scarbo]

duplicateMovieClip("ball","newball" + i,100)

Глубина одна и таже.
А по-хорошему должно быть так:

var i = 0;
function double() {
	var X:Number = Math.random()*550;
	var Y:Number = Math.random()*440;
	ball_mc.duplicateMovieClip("ball_mc"+i,i);
	_root["ball_mc"+i]._x = X
	_root["ball_mc"+i]._y = Y
	i++;
}
var Time = setInterval(double, 1000);

И ни каких заумностей не надо