[iNils]

От флекса тут только компилятор.

А под компиляций проекта подразумевается компиляция fla файлов? Тогда забудьте, что я написал и используйте способ mre.

Лично я работаю фактически без Flash IDE, он используется только для создания swc библиотек. А так вся работа ведется в FD и компиляция происходит на базе mxmlc. Если нет анимации, то Flash IDE вообще не открывается, а все картинки добавляются через [Embed].