[gloomyBrain]

Смотря что вы хотите делать с файлами на компьютере пользователя
Если загружать их на сервер - тогда почитайте про FileReference
Если читать и изменять эти файлы - ...
- только после загрузки файлов на сервер
- можно загрузить содержимое во флеш
- изменить его и отправить серверу измененное
- после получения сервером измененного файла выдать во флешь ссылку для его скачивания

2-ой способ
создаем одну флешку с доступом только к сети, вторую с доступом только к локальным файлам
после чего организуем LocalConnection между ними

однако и в том и в другом случае Вы не сможете напрямую изменять содержимое файла на комьютере клиента