[Fatality]

AS - не JavaScript, хотя они и созданы по одному и тому же стандарту ECMAScript.
Ближайшим аналогом alert() и confirm() в AS, является компонент Alert.

import mx.controls.Alert;
Alert.show("сообщение", "окно", Alert.OK | Alert.CANCEL, null, Handler);
function Handler(event:Object)
{
	if(event.detail == Alert.OK) trace("вы нажали ОК");
	if(event.detail == Alert.CANCEL) trace("вы нажали CANCEL");
}

Для того чтобы код работал, в билиотеке должен быть компонент Alert.