[aksios]

koIIImarik,
1 - pIRender сохраняет альфа канал, если формат видео позволяет это сделать.
2 - не знаю, зачем вам это нужно делать в Photoshop. Это делается в AE.
После AE видео из pI прекрасно экспортится в flv с альфой.
3 - много букв не о чем.