Я сейчас этим занимаюсь, пишу свой простой сокет сервер на Java
В сети есть туториал от Giant Flying Soucer`a про то как написать свой сокет сервер на Java или C#
Building a Flash socket server with Java in five minutes
A Flash/Flex socket server in 5 minutes with C#
Building a Multi-user Chat Server with xSocket, Java, and Flash CS3
Правда, если мне не изменяет память там все для XMLSocket, не для бинарного. И в туториалах не говориться о policyfile
Там еще можно скачать бесплатный сокет сервер на Java, GFS Server называется
Добавлено через 3 минуты
Насчет PHP, на торрент.ру где-то был чат на флэше и к нему прилагался сокетсервер написаный на php + на java