примерно так:

Код AS3:
public function compareByteArray(value1:ByteArray,value2:ByteArray):Boolean
{
if (value1.length == value2.length)
{
var i:uint = value1.length;
while (i--)
{
if (value1[i] != value2[i])
{
return false;
}
}
return true;
}
return false;
}