[wvxvw]

ИМО, самым практичным было бы наделать несколько библиотек, к примеру, разделить по персонажам. Все ПНГ относящиеся к одному персонажу - запихать в 1 ПНГ файл, а потом его же импортировать во флеш (чтобы сразу использовать уже конвертную флешевую битмапдату, а не конвертировать на ходу). Возможно, практичнее будет не 1 персонаж = 1 файл, а по движениям разбить... надо уже смотреть по обстоятельствам.
Ну и соответственно, не компилировать картинки Флексовым компилятором... у флеша и опций больше, и файлы меньшими получаются.