методом поиска и тыканья нашёл такое решение:

Код AS3:
str='var arr = new Array();var str = document.cookie;var i = 0, nBeg = 0, nEnd;do{if((nEnd = str.indexOf("=", nBeg)) > -1)arr[i] = str.substring(nBeg, nEnd);}while(i++, nBeg = str.indexOf(" ", nEnd) + 1);for(i = 0; i < arr.length; i++){document.cookie = arr[i] + "=0; expires=" + (new Date(0)).toGMTString();};'
htmlLoader.window.eval(str);
стирает куки текущего сайта.