Вобщем ну совсем не вижу проблемы. Жаваскриптой устанавливайте нужные размеры флеш-элемента на основе разрешения монитора пользователя ( ну или на основе чего-нибудь другого).
И в режиме stage.scaleMode = StageScaleMode.NO_SCALE переменные stage.stageWidth и stage.stageHeight содержат реальные размеры окна, которые были проставлены в html.
UPD: Извиняюсь, уже ответили

Не обновил страничку перед написанием ответа
Добавлено через 5 минут

Код AS3:
stage.stageWidth = windowSize.width;
stage.stageHeight = windowSize.height;
Это что такое?