[etc]

У вас есть N объектов. С каждого можно получить его границы (bounds) методом getBounds (или getRect), который возвращает прямоугольники Rectangle. Также у вас есть Rectangle выделения. Поочередно проверяя пересечения каждого из bounds с прямоугольником выделения, записываете в массив ссылки на эти объекты. Или сразу ставите им свойство selected (если таковое есть и вами описано) в true.